Fagskolestyret er økonomisk og juridisk ansvarlig for all fagskoleutdanning. Styret er også økonomisk og juridisk ansvarlig for kursvirksomhet som blir tilbudt av fagskolen.  

Styret skal bidra til å legge premissene og utforme strategi for utviklingen av fagskoleutdanningen innenfor de mål og rammer som gjelder for Fagskolen i Finnmark. I tillegg til å ha fokus på høy kvalitet og gode utdanningsvilkår, skal fagskolen også være en regional utviklingsaktør med fleksibilitet i utdanningstilbudene.